五险一金

本人就职于单位是合并公司，其主体合同在原合并单位，但是现公司上五险一金存在问题，五险中的基数是今年6月份在上调的，以前一直按照1680元的基数缴纳保险（并且我于2010年9月上旬在原合并公司入职，保险在2011年11月份才开始给本人缴纳），但是公积金一直没有，也与其人资协商并强调过此方面本人的权力及公司的义务，但是一直无果，原因在于主体合同在原合并之前的单位，本人就职已经快两年，请问我应该怎么主张自己的权力！
补充提问：
如果劳动仲裁，时间会不会有限制，指当事人知道或者应当知道一年之内劳动仲裁，会不会过来劳动仲裁的期限？如果过了期限本人还能怎么主张自己的权力？