有关打架的问题

请问各位朋友之前与人打架了，当时对方用棍子打了我朋友，而我朋友没使用任何工具，之后报警，在派出所要结案如果不结案的话双方都要拘留，当时对方给我朋友道歉，我朋友就同意签协议了，（当时签的时候只是签了名字，协议内容是空白的，事后派出所不承认）不去医院看病，之后当天下午朋友就去了公安医院了，因为棍棒打到头部，之后住院了几天，又在家养了近1个月，之后朋友把对方起诉到法院，被告说因为当时有那个协议就不需要赔偿我朋友的医药费，这个案子还没有结完，因为经济原因朋友没有请律师，所以我请问朋友可以申请赔偿吗？ 如果可以，根据是什么，需要怎么做呢？ 在这里替朋友先谢谢各位！
补充提问：
协议内容：双方互相不追究刑事责任
双方都不去医院看病
但是这个协议对朋友不利，但是派出所不承认签的时候是空白的