买房违约金的支付问题

我在一小区购房 并签订合同 ：
1 合同规定逾期三个月之内不需支付违约金：
2 三个月后按已付房款的千分之五每日支付违约金：
3 房款总价为二十一万四千 现在出去不需支付违约金的三个月 另超出了五个月：
4 售楼处通知可以拿房 违约金暂时不与支付 让业主与开发商协商解决

请问：
1 合同所注的房款千分之五是全额房款还是首付（按揭贷款买的房子）
2 对于售楼处的说法是否合理
3 如果不合理业主是不是就拿不到违约金
补充提问：
现在售楼处通知我拿钥匙
可是根据他说提供的书面说明还缺少“房屋验收合格证明”
而且房屋面积比购房合同少了1.76个平方 对于少掉的面积现在不与理赔 应该不合法吧？？？