法律咨询，邻里纠纷

91年父亲单位分房时带有一间自建房，建于70年代。
83年邻家搬来本院，将我自建房南侧的无证房8.4平米变更为私房（有证据）。87年他获得区规划局同意，对其私房进行翻建。条文上批准他20米左右的面积。当时他为了多给自己住房留有空间。将自己房的南侧留出了空地，又向北借用了我的自建房墙体，把我自建房的十几根横梁砌进了墙里，并展高了自己的房子。形成了两家共用一堵墙的局面。
2000年他又获取了合法证书。
09年他想将平房翻建成楼房，由于，拆墙时必拆我自建房，我没同意，他向法院告我，说我盖房时借用了他家墙体，还借用房梁损坏他家房屋。法院不支持我没有产权证的辩护，强行拆除了我的自建房。之后我又重新起墙盖起，他又向法院起诉我，说我新盖的房子距他墙体不足40cm，使他无法检查维修墙体。现未开庭，让法院判还拆除此房。
现在，我查到了87年他翻建时的官方批文和施工图纸，图纸明确标有他翻建的位置和我自建房的位置。并且针对我自建房还给他做出了明确规定：“该房不得向东、北展出。”以及“各项内容图纸不得变更，否则为违章。”
以上充分证据说明在当时翻建时，他没有按照政府部门的规定翻建，而是违章翻建。给我造成了之后的一系列损失。
他现有产权证，我仍是自建房，我能向法院起诉他当时的违规行为，讨回我失去的自建房的经济损失吗？

谢谢