违约金

我06年和公司签订6年劳动合同，合同规定不满6年我辞职的话要赔偿违约金25000元。前段时间去公司辞职公司叫我赔偿5000多的违约金，还有9000多的补充公积金。5000多的违约金说法是当时签订合同的每年递减所以要赔偿5000多，根据08新劳动法我又不涉及机密行业，也没有培训过。我为什么还要出这笔违约金呢？还有9000多的补充公积金单位的说法是，我们赔偿总补充公积金的百分之40.所以是9000多，这个我也不明白，补充公积金这种不是公司的福利吗？为什么我也要赔偿呢？请问公司的做法是否合理？我该不该支付？谢谢