通过中介买二手房的问题

上周，我们通过中介买了一个二手房，房子是准现房，还没有房产证，开始交订金签协议的时候，房主说出差呢，他朋友给代签的，我们上周把首付款打过去了之后，下午去售楼处改名的时候，房主说因为是政府的人，不方便露面，没有去，本来不想签了，然后因为他和售楼处的人认识，所以，售楼处的经理给担保，直接改的名，我们拿到了购房合同，但是改名协议上房主没在，没签，他说给补签，但是如果他不补签的话会不会以后留下什么隐患和纠纷呢？首付款已经打过去了，我比较担心这个房子是不是后期会有什么问题，想咨询一下，谢谢！