工伤后不能从事管理培训生关于基层岗位的工作离职问题

7月9号开始管培生的为期15天的军训，第五天就骨折了，军训完后要轮岗，岗位为前台、客房、销售。工伤期间公司只支付了2个月工伤工资，医药费是培训公司的人赔。我在10月1号提出了离职，当时腿上下楼梯，走路都有问题，寄宿在表姐家里，当时一个人照顾自己给别人添麻烦，心里特别难受，腿还没好就被叫去拉客。感觉身体和心里都挺难过的。我现在腿长时间站立都疼，感觉已不能从事其基础轮岗，在此期间提出的辞职，公司也办了离职手续，但要开具离职证明和拿到自己的档案，公司让赔付6000元违约金，我该怎么办？