关于股权证明

律师您好！
我2年前进入这家公司，当时公司属于创业阶段，由于承担重要角色，公司答应给我一定的股份，并在2年内逐步生效，每月可以拿到48分之一。并签订一份书面协议。目前2年时间已到，由于中间融资和发放期权，股份已经稀释一部分，所有融资和期权发放协议我都已经签字了。目前由于与公司的矛盾，我希望退出公司。但是面临几个问题？
1、我如何证明我是股东，拥有股权？
2、公司的业务分散在几个公司上面，我只有一家公司的股权协议。其他公司和这家公司没有从属关系，但是公司的期权和融资大部分也在这家公司上面。那我的股份在套现上，是对这家公司的估值还是整个企业的估值？