高校毕业生三方协议的问题

我是今年六月毕业的应届大学毕业生，2010年12月开始在西安某公司实习，实习三个月后与公司签订了劳动合同为期一年。现在需要给学校寄回三方协议，故需与公司签订三方协议，但是公司要求备注必须最少在公司干满两年，并且公司有权随时解雇，请问这份协议上的备注是否合法？我是否必须执行？协议是否在毕业生拿到毕业证之前有效？
补充提问：
你的意思是这份三方协议不具有法律约束力吗？我可以不按照协议约定干满两年吗？那如果合同中已经约定好了违约金问题，违约金为1万元，那么我如果要辞职是不是就要涉及违约金了。我该怎么辞职呢？谢谢啦！