因工作失误 产生法律纠纷后 员工和企业的责任分配

在2010年春天 我们团队为公司实行网上推广竞价排名的活动 由于操作失误 使我们公司被另一家公司起诉 后赔偿另一家公司人民币两万多元，现公司要求员工承担40%的赔款 原来公司并没有这方面的相关制度规定 请问 是否合理

补充：另外 当初做网络推广工作 我们都是没有经验完全是尝试性的 也没有经过专业学习 并且这个是由我们团队造成的 具体无法判断是我们几个人谁的责任 公司要求从我们的3万元奖金中扣掉一万左右 而这3万元奖金 仅仅是项目收益的5% 也就是说员工和企业的利润分配是 5：95 而责任承担分配是 40：60 因为这个 我们团队 觉得十分不平衡
想请问这种处理结果 是否合理合法
补充提问：
如果申请仲裁 需要提交什么材料或相关证据 ？电子邮件是够有效？申诉有无有效期限