非法占用河道，导致房屋冲垮，要求赔偿

中铁十七屏古高速A3项目，在河道非法搭建一个钢筋厂河道变窄，导致大雨来水位上涨的时候冲垮房屋。至今不赔偿损失也不拆除非法占用河道的钢筋加工厂。
我不知道申诉率高不高，我们没有房产证因为是农村房子，但是是我们自己的，
问题一：请问可以先上诉政府，成功后再上诉这个非法建筑者，因为上诉政府的话费用低.
问题二：要提供什么证据，房子占地500平方左右。有相片。对方非法建筑还。
问题三：因为他是占用地方建筑，是间接造成我的损失，需要责任鉴定吗？还有房屋价值如何评估？