怀孕期间能否降职降薪

项目领导在9月1日以我已怀孕3个月为由，向公司行政部提出了将我退回行政部，由行政部另行安排岗位的要求。
我仔细阅读了我的劳动合同，在约定的其它事项中，有一条“劳动合同期内，员工未达到合格上岗条件而待岗期间，仅发基本工资，不享受岗位工资，奖金和除法定福利以外的各项福利、津贴与补贴。”但是，我在查阅了相关法律法规时，不得在女职工在怀孕、产假、哺乳期间降低基本工资，或者解除劳动合同。
2009年9月6日，公司通知项目部，宣布我不再担任项目的工作，并要求我9月15日回行政部报到。然后口头通知我，从10月份开始，我将处于待岗状态，工资只按照每月1000元的基本工资发给我，公司这样做是否合法？另外，如果我打算在10月10日拿到工资之后申请劳动仲裁，是不是超过了申请时效（因为公司的工资发放是10月10日才发9月份的工资，我现在还拿不到工资变动的证明）？我该怎么样维护自己的相关权利呢？