工资补助问题

我在北京丽倍生科技有限责任公司工作，这家公司的老板旗下还有另一家公司，去年9月份，要我同时负责他另一家公司的采购，我从去年9月份开始负责该公司采购业务，并到3月份我在丽倍生的合同到期，这期间我要求他们兑现补助工资的事情，一直没有给出明确的答复，总是敷衍，也不给书面的东西，我现在手里有我负责另一家公司的采购证据，能不能让他们按同工同酬的标准要求他们支付工资呢。我去海淀区仲裁 申诉了，他们说这属于兼职的范畴，他们说这个应该去法院，但是我对法院处理我这样的问题不知道怎么走程序。还有建议我去劳动监察的，必须是公司所在地吧，请您回复