分期付款的房产继承分配问题。

我父亲原住单位（政府单位）的无产权房（之前房子交了一万多元，房子属自己的，但没有房产证，无出让权），2009年父亲单位在别处盖楼，条件是交原来的住房，加钱换购新盖的房。2009年9月我父亲先交18万元的第一次交款，当时规定余款可按揭可分期付款。不料我父亲于2010年2月突然因心脏病去世，生前未立遗嘱，也未有任何遗言。到了2011年12月，父亲单位要交清房子余款，因我父亲已去世，也不能按揭，只有一次性交清。我与我大哥两人就一起把余款28万交清了。现在的问题是，房子原先登记的是我父亲的名字，因人已去世，要办理新房产证改换名字，得经过继承公证。继承人涉及到了我父亲十几年都未有联系的他前妻（父亲与我母亲是二婚 ）的女儿。
我现要想请懂的人告诉我下，后面这28万元的余款是我和我大哥交的，在继承公证时会不会算到我父亲的遗产中去来分配。还有一个问题，买这个新房一共交了46万，我父亲当时交了18万，是按这18万来分配还是按现在折合的房价来算（房子虽然到现在还没盖好，但按地段房价上涨了四分之一）。请高人帮忙 谢谢了。