单位让我签培训协议时没有费用,辞职时出现费用补偿

2010年初 单位培训我们单位三个人去学习,每个人签了一份协议书,上面把涉及到的费用一项划掉了.
2011年8月我提出辞职,单位说当时是有费用的,就是没往上面写.要扣我350元.

还有一件事就是 我去这个单位工作时2009年初,培训一项测量机检测,我是新去的,正好他也是新买的机器,厂家就来人对我们几人进行培训,并且后来给了上岗资格证.这个当时也没说有任何费用,现在辞职了,工作年限是2年半,现在单位也要扣我钱...我觉得就是不公平,和单位的关系也挺好,可是我还是想维护自己的合法权益.