诉讼时效问题，希望能尽快知道怎么办，多谢。

大概在2009年10月前后，得到税务局朋友消息称可以为单位办理长期免税事宜，目前是属于少数试点单位可办，没有对社会单位公开，根据单位以前的纳税数额订“朋友价”，我单位交十万就可以办理，我作为单位领取此笔款项的唯一经手人，在经老总的同意签字认可的情况下，在单位打下了字据说明办理什么事项取走现金十万元，并交给了税务部门办事的人手里，当时因为想免税求人办事走后门，就没留什么证据（如字据之类的）。

事后两个月左右的时间，单位得知社会像所有单位都统一实施免税制度了，单位老总就让我向办事的部门要钱，当时他们还说刚递给上面，让等半年左右的时间，老总答应了也就没在催促。

直到现在还没有退还，其间我出面找办事的人几次，从开始的推拖变成了现在的死不认账。

因为我手里没有给人家的字据，而老总手里又有我打下的字据，说给我两条路，要不就再给那个政府部门的办事人通个信，说不给退就找他们领导让他吃不消，要不就把我和他一起告上法庭。

现在我是夹在中间有苦说不清，这件事让我烦心了也快两年的时间了，平时工作不允许自己出现什么差错，没想到，在这件事上吃了哑巴亏了，有时半夜睡不着就想这件事是自己做的窝囊，那就我赔掉算了，免得让一向赏识我的领导因此对我另眼相看，因为这件事，领导已经对我不信任了，让我非常烦心。

可是想想十万也不是个小数目，自己要赚几年才能赚回来的，因此非常不甘心，但又怕惹上官司，到时候还没有理，真不知道该怎么办了，请律师帮忙看看我应该怎么办是好！！多谢！
我没有办法收集到什么有力证据了，人家都不提及此事，也拒不回答，说我再提就是诽谤，而且到今天那个医院的负责人没有在找我提起此事，我想问下，这件事是不是有上诉期，上诉期是多久，是不是过了上诉期他们就没有权利上诉了？？？？这件事也就不了了之了呢！多谢您！
重点是当我意识到我应该取证保护自己的时候，发现收取财物的一方政府部门已经全盘否认这件事的存在了，所以我有点要吃哑巴亏的状态，现在最关心的是如果我不能取到对自己有力的证据的话，单位的起诉是不是有时限的呢，如果过了2年是不是想追究也不能追究了呢？谢谢