关于多发工资后续问题

我是一名人事专员，因一次事故，多发一名员工工资两万多。
现该员工已离职，他本人承认这笔多付的工资，但一直拖着不还。我一直催还这笔钱，他在7月底还了一万之后就又拖着了。
现在公司要追究我的责任，说如果员工不还，就要我承担剩下的一万多。
问题1，员工已离职，2，当时的工资是通过我司专有系统，在深圳发的，我司公司地址在江苏无锡。这种情况下，我该怎样收回这笔剩下的款项？
公司问我要这笔钱，我不愿意全部承担，当时公司没有人审核我的工作，公司制度有漏洞。如果我不拿出来，公司可以开除我吗？或者如果我自己辞职，手否要赔了这笔钱才能辞职？