赔偿给公司的违约金是否可以进行税前扣除？

你好！
我跟公司有协议，约定从11年1月起，为公司服务满5年；否则需要根据服务年限赔偿公司（总额12万元）。13年底我从公司离职。按照协议，我需要付给公司4.8w违约金。
同时，我在离职时，仍然可以获得公司13年的奖金、13薪等共计8w元。
我想咨询的是，我的4.8w元违约金是否可以在8w元奖金中进行税前扣除？即，8w－4.8w＝3.2W元。然后以3.2W元进行个人所得税扣除。
或者是，公司以8W进行个人所得税扣除，约6.4W元。然后6.4W－4.8W＝1.6W元。
请问哪种个税扣除方法是正确的？有没有相应的国税总局文件规定？谢谢！