补开普通高等院校毕业生报到证

我2001年7月本科毕业，签了一家企业。因想先就业一段时间再读研究生，所以档案和户口留在学校没有迁走。同年7月进入该企业工作两年，后于2003年考取研究生，9月入校，并从本科院校办理了相关调档手续。2006年6月研究生毕业后考取博士并于2009年毕业，之后一直在高校及研究所工作，有事业编制。现单位计算我工龄时发现我本科毕业时的档案上注明我没有报到证，要补办，否则工龄从2009年算起。请问我本科毕业时的报到证能补办吗？有什么依据？
补充提问：
感觉现在本科学校在踢皮球，我应该怎么做？虽然我也知道这样问很弱智，但高校就是这样，我想如果有相关依据对方就不会这样推卸责任了。