小产权房现在过户都上啥税

我07年买的在建房，签的是集资购房合同，交钱开的是收据。08年9月建好，10月办的入住，13年3月17号开发商才办好房产证，现在让我们办过户，74平房现在上税2万多。税由我上的原因是最初的合同规定都是乙方的，由于甲方现在造成房产证才办好，合同上约定的是谁违约就向对方赔1万，甲方现在说呢合同不算。我第一次买房，过户上二手房的税，无法协商，现在我也不知道怎样办好，过还是不过户，还是先过户在打官司要他造成的损失，该找谁问，也不知该咋问，拜托回答详细些，先谢谢了律师
补充提问：
开发商说购房时的合同没用，现在所有的他该上的税都有我们上，我们想告就告，他没钱。这么说告赢了我们也拿不到补偿。那个所谓合同只是和他的一个协议，废纸一张，是这样的吗？我们该怎样做?