该考核协议的罚款是否有法律效力

尊敬律师:

我公司同一家电力总承包单位签订了一份工程分包合同，主要承建内容为某区域的系列单体工程（基础、主体、装饰等土建），合同标的为2500万，后又增补500万，具体区域和单体工程不变，合同工程完成工期截止为2008年1月15日。

因业主要求对我方施工区域中的一条生产线要提前投入使用，故总承包单位要对我方的施工进度节点进行考核，双方签订了一份进度考核协议（特别注明该协议作为合同的附件），并对各单体各节点的工期作了详细规定，特别是对于节点工期延误的处罚规定（原文表述：某单体主体某月某日完成，每延期一天罚款多少元）。后来因原协议不能实现，途中又以工程联系单的方式调整了最终的完成日期，我方按照调整后的日期按期完成了，但总包单位称调整工期不作考核依据，在百般无奈的情况下双方签了一个关于合同的执行情况备忘录，里面提到我方拖延工期的具体天数及表明调整工期不作考核依据。现在工程已经全部竣工，并在原合同规定总工期的前提下提前2个月。现想咨询一下律师，该考核协议的罚款是否有法律效力，谢谢