药品欠款不受法律保护吗

我爱人是药店负责人，在店里接了一个同学送来的药品，对方拿了手续，但是不全，考虑认识，有问题能找到他，就收下了，并付了货款，但写了药品质量有问题退货的条子。结果不长时间真的质量出了问题，因此把药退了回去，在他拉走药时写了数量和钱数的条子。但是这钱五年一直未还，我爱人一直在要。今年一月我爱人起诉到法院。时隔2月，法院的法官以药品买卖不受法律保护，并说我爱人在药店和对方是私下交易，准备驳回我们的起诉，还让律师告诉我们法院判决书下来，我们就一分钱也要不到，然后又通过律师把我们双方叫到法院，说是调解，让对方给我爱人5500元，并让我爱人（女）撤诉。结果我爱人按法官的意见做了。欠了五年多的12400元钱，通过官司，去了费用就剩3500元。

咨询 一、药品买卖是否受法律保护

二、我爱人在药店做生意是否是私下交易

三、法官的这样处理对吗

四、我们还能怎样做

恳请能够得到一个正确的解释，

谢谢你们