请帮我解决麻烦的借款案

昨天已经有两为律师解决了我的问题,在此表示非常感谢!
我想补充一下我的案情，2009年11月左右，单位说我还有1000元借款没有还，这么多年中间单位也从未催讨过，况且这些年他们都知道我不缺钱。今天单位领导找到我并拿出了我当初的借款条，借款条上领导的批示是：同意借款，限年底还清。我当初的借款数额是2000元，领导拿出我2003年用往来款抵还1000元的收据，现在单位说我还剩1000元没有还，而我记得不欠单位的钱了，我是用现金还的，但也不知具体是什么时候还的，隔得太久了，收据也找不到了。请问：如果单位强行扣我的工资等款，我就只好打官司了。不知我的胜算如何？请您指点，我要怎样说才能得到法庭的支持?我有义务将还款收据保留这么久吗？单位不追讨是不是表示他们放弃追讨欠款，同时也说明我已经还了那笔钱？